Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms