Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
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