Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ccdc88cQ6VGS5 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ccdc88cQ6VGS5 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ccdc88cQ6VGS5 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ccdc88cQ6VGS5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ccdc88cQ6VGS5 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ccdc88cQ6VGS5 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ccdc88cQ6VGS5 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Ccdc88cQ6VGS5 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Ccdc88cQ6VGS5 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Ccdc88cQ6VGS5 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Ccdc88cQ6VGS5 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Ccdc88cQ6VGS5 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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