Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vstm2lQ6PDS0 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vstm2lQ6PDS0 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vstm2lQ6PDS0 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vstm2lQ6PDS0 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vstm2lQ6PDS0 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vstm2lQ6PDS0 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vstm2lQ6PDS0 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vstm2lQ6PDS0 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vstm2lQ6PDS0 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vstm2lQ6PDS0 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vstm2lQ6PDS0 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vstm2lQ6PDS0 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vstm2lQ6PDS0 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
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