Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms