Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms