Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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Ccdc18Q640L5 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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Ccdc18Q640L5 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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Ccdc18Q640L5 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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Ccdc18Q640L5 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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Ccdc18Q640L5 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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Ccdc18Q640L5 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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Ccdc18Q640L5 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc18Q640L5 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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