Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim28Q62318 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Trim28Q62318 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Trim28Q62318 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim28Q62318 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Trim28Q62318 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim28Q62318 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Trim28Q62318 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim28Q62318 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms