Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

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Length 883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BcanQ61361 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BcanQ61361 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
BcanQ61361 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
BcanQ61361 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BcanQ61361 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BcanQ61361 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BcanQ61361 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BcanQ61361 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BcanQ61361 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BcanQ61361 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BcanQ61361 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BcanQ61361 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
BcanQ61361 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BcanQ61361 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BcanQ61361 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BcanQ61361 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BcanQ61361 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BcanQ61361 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BcanQ61361 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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BcanQ61361 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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BcanQ61361 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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BcanQ61361 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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BcanQ61361 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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BcanQ61361 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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BcanQ61361 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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BcanQ61361 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BcanQ61361 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BcanQ61361 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
BcanQ61361 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BcanQ61361 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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