Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

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Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tsr1Q5SWD9 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Vmn1r5-201ENSMUST00000164307 1056 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Tsr1Q5SWD9 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Tsr1Q5SWD9 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
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Tsr1Q5SWD9 Clec2g-202ENSMUST00000075789 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Tsr1Q5SWD9 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Tsr1Q5SWD9 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Tsr1Q5SWD9 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Tsr1Q5SWD9 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Tsr1Q5SWD9 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Tsr1Q5SWD9 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Tsr1Q5SWD9 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Tsr1Q5SWD9 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Tsr1Q5SWD9 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Gm13487-201ENSMUST00000122240 864 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Gm15680-201ENSMUST00000161597 465 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
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