Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms