Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Bhlha9Q5RJB0 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Bhlha9Q5RJB0 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Bhlha9Q5RJB0 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Bhlha9Q5RJB0 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Bhlha9Q5RJB0 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Bhlha9Q5RJB0 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Bhlha9Q5RJB0 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Bhlha9Q5RJB0 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Bhlha9Q5RJB0 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlha9Q5RJB0 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms