Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms