Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fchsd2Q3USJ8 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fchsd2Q3USJ8 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fchsd2Q3USJ8 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Fchsd2Q3USJ8 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fchsd2Q3USJ8 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fchsd2Q3USJ8 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fchsd2Q3USJ8 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fchsd2Q3USJ8 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fchsd2Q3USJ8 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Fchsd2Q3USJ8 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Fchsd2Q3USJ8 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fchsd2Q3USJ8 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fchsd2Q3USJ8 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Fchsd2Q3USJ8 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms