Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.9 ms