Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH1

Prrc1, Protein PRRC1, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc1Q3UPH1 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prrc1Q3UPH1 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prrc1Q3UPH1 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prrc1Q3UPH1 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prrc1Q3UPH1 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prrc1Q3UPH1 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prrc1Q3UPH1 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prrc1Q3UPH1 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prrc1Q3UPH1 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prrc1Q3UPH1 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Prrc1Q3UPH1 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prrc1Q3UPH1 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prrc1Q3UPH1 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Prrc1Q3UPH1 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prrc1Q3UPH1 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prrc1Q3UPH1 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Prrc1Q3UPH1 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prrc1Q3UPH1 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Prrc1Q3UPH1 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prrc1Q3UPH1 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prrc1Q3UPH1 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prrc1Q3UPH1 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Prrc1Q3UPH1 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Prrc1Q3UPH1 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prrc1Q3UPH1 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prrc1Q3UPH1 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prrc1Q3UPH1 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Prrc1Q3UPH1 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prrc1Q3UPH1 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Prrc1Q3UPH1 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Prrc1Q3UPH1 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prrc1Q3UPH1 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prrc1Q3UPH1 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prrc1Q3UPH1 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prrc1Q3UPH1 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prrc1Q3UPH1 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prrc1Q3UPH1 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prrc1Q3UPH1 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prrc1Q3UPH1 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Prrc1Q3UPH1 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prrc1Q3UPH1 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prrc1Q3UPH1 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prrc1Q3UPH1 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prrc1Q3UPH1 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prrc1Q3UPH1 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prrc1Q3UPH1 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Prrc1Q3UPH1 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Prrc1Q3UPH1 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prrc1Q3UPH1 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prrc1Q3UPH1 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prrc1Q3UPH1 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Prrc1Q3UPH1 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prrc1Q3UPH1 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prrc1Q3UPH1 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prrc1Q3UPH1 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Prrc1Q3UPH1 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Prrc1Q3UPH1 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prrc1Q3UPH1 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prrc1Q3UPH1 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prrc1Q3UPH1 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prrc1Q3UPH1 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Prrc1Q3UPH1 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Prrc1Q3UPH1 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prrc1Q3UPH1 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prrc1Q3UPH1 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Prrc1Q3UPH1 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prrc1Q3UPH1 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prrc1Q3UPH1 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prrc1Q3UPH1 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prrc1Q3UPH1 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prrc1Q3UPH1 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prrc1Q3UPH1 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prrc1Q3UPH1 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prrc1Q3UPH1 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prrc1Q3UPH1 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prrc1Q3UPH1 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prrc1Q3UPH1 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prrc1Q3UPH1 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prrc1Q3UPH1 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prrc1Q3UPH1 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prrc1Q3UPH1 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms