Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UPC7 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UPC7 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3UPC7 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3UPC7 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3UPC7 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3UPC7 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms