Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW8

Parp3, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp3Q3ULW8 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms