Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms