Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGM2

Nek10, Serine/threonine-protein kinase Nek10, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek10Q3UGM2 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nek10Q3UGM2 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nek10Q3UGM2 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms