Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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