Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q3U6N9 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q3U6N9 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q3U6N9 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Q3U6N9 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q3U6N9 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q3U6N9 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q3U6N9 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q3U6N9 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
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