Protein–RNA interactions for Protein: Q3U5F4

Yrdc, YrdC domain-containing protein, mitochondrial, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YrdcQ3U5F4 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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YrdcQ3U5F4 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
YrdcQ3U5F4 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms