Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
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