Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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