Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Samd11Q1RNF8 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms