Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms