Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms