Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms