Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ttc21bQ0HA38 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms