Protein–RNA interactions for Protein: Q08EJ0

Plac8l1, PLAC8-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plac8l1Q08EJ0 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Plac8l1Q08EJ0 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms