Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rbp2Q08652 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms