Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Hoxc4Q08624 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Hoxc4Q08624 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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