Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms