Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms