Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Thbs3Q05895 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Thbs3Q05895 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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