Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms