Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms