Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms