Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gjb5Q02739 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms