Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
GscQ02591 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
GscQ02591 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
GscQ02591 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
GscQ02591 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
GscQ02591 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
GscQ02591 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
GscQ02591 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
GscQ02591 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
GscQ02591 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
GscQ02591 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
GscQ02591 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
GscQ02591 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
GscQ02591 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
GscQ02591 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
GscQ02591 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
GscQ02591 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
GscQ02591 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
GscQ02591 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
GscQ02591 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
GscQ02591 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
GscQ02591 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
GscQ02591 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
GscQ02591 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
GscQ02591 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
GscQ02591 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
GscQ02591 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
GscQ02591 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
GscQ02591 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
GscQ02591 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
GscQ02591 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
GscQ02591 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
GscQ02591 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
GscQ02591 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
GscQ02591 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
GscQ02591 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
GscQ02591 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
GscQ02591 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
GscQ02591 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
GscQ02591 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GscQ02591 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GscQ02591 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GscQ02591 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GscQ02591 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
GscQ02591 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
GscQ02591 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GscQ02591 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GscQ02591 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
GscQ02591 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GscQ02591 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GscQ02591 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GscQ02591 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GscQ02591 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GscQ02591 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
GscQ02591 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GscQ02591 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GscQ02591 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
GscQ02591 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GscQ02591 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GscQ02591 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GscQ02591 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GscQ02591 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GscQ02591 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
GscQ02591 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
GscQ02591 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
GscQ02591 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
GscQ02591 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GscQ02591 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
GscQ02591 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
GscQ02591 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GscQ02591 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
GscQ02591 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
GscQ02591 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
GscQ02591 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GscQ02591 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
GscQ02591 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GscQ02591 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GscQ02591 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GscQ02591 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
GscQ02591 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GscQ02591 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GscQ02591 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
GscQ02591 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GscQ02591 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
GscQ02591 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GscQ02591 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GscQ02591 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GscQ02591 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
GscQ02591 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GscQ02591 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GscQ02591 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GscQ02591 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GscQ02591 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GscQ02591 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GscQ02591 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GscQ02591 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GscQ02591 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GscQ02591 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GscQ02591 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GscQ02591 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms