Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms