Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms