Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 206.1 ms