Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Top2aQ01320 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms