Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms