Protein–RNA interactions for Protein: P98195

Atp9b, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, mousemouse

Predictions only

Length 1,146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9bP98195 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp9bP98195 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms