Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AlkP97793 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AlkP97793 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AlkP97793 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AlkP97793 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AlkP97793 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AlkP97793 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AlkP97793 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AlkP97793 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AlkP97793 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AlkP97793 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AlkP97793 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AlkP97793 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AlkP97793 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AlkP97793 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AlkP97793 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AlkP97793 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AlkP97793 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AlkP97793 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AlkP97793 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AlkP97793 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AlkP97793 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AlkP97793 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AlkP97793 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AlkP97793 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AlkP97793 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AlkP97793 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AlkP97793 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AlkP97793 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AlkP97793 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AlkP97793 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AlkP97793 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AlkP97793 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AlkP97793 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AlkP97793 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AlkP97793 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AlkP97793 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AlkP97793 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AlkP97793 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AlkP97793 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AlkP97793 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AlkP97793 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AlkP97793 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AlkP97793 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AlkP97793 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AlkP97793 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AlkP97793 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AlkP97793 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AlkP97793 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AlkP97793 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AlkP97793 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AlkP97793 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AlkP97793 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AlkP97793 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AlkP97793 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AlkP97793 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AlkP97793 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AlkP97793 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AlkP97793 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AlkP97793 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AlkP97793 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AlkP97793 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AlkP97793 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AlkP97793 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AlkP97793 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AlkP97793 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AlkP97793 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AlkP97793 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AlkP97793 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AlkP97793 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AlkP97793 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AlkP97793 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AlkP97793 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AlkP97793 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AlkP97793 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AlkP97793 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AlkP97793 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AlkP97793 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AlkP97793 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AlkP97793 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AlkP97793 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AlkP97793 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AlkP97793 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AlkP97793 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AlkP97793 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AlkP97793 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AlkP97793 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AlkP97793 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AlkP97793 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AlkP97793 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AlkP97793 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AlkP97793 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AlkP97793 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AlkP97793 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AlkP97793 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AlkP97793 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AlkP97793 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AlkP97793 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AlkP97793 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AlkP97793 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms