Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
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Bop1P97452 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
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Bop1P97452 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Bop1P97452 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Bop1P97452 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Bop1P97452 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Bop1P97452 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Bop1P97452 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Bop1P97452 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Bop1P97452 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Bop1P97452 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Bop1P97452 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Bop1P97452 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Bop1P97452 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Bop1P97452 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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