Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcdP82347 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcdP82347 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcdP82347 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcdP82347 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcdP82347 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcdP82347 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcdP82347 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcdP82347 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcdP82347 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SgcdP82347 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SgcdP82347 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SgcdP82347 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
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